棋牌平台游戏代理|凤凰棋牌平台


  • 免費服務熱線
  • 400-065-6886
  • 電話:86(0)512-6295 9990
  • 傳真:86(0)512-6295 9995
新聞中心

circRNA m6A修飾文獻總結及思路分析

發稿時間:2020-01-02來源:天昊生物


 

2019國自然最全m6A RNA甲基化解析中曾提到“今年m6A RNA甲基化最大的特點是非編碼RNA相關的內容大幅增加,醫學相關共計47”其中一個方向就是circRNA本身發生m6A修飾或者circRNA作為一個regulator影響其它RNA的m6A修飾,2019年有關circRNAm6A國自然項目共計11

 

從PubMed中檢索circRNA相關的m6A文章,截止目前僅8篇文章(3分以上)與circRNA相關,這些文章均是在2017年之后發表的,其中10分以上有5篇文章(今年4篇)

 

最早于2017年中科院上海生命科學研究院的科研團隊在Cell Research上首次報道稱N6-甲基腺嘌呤能夠驅動環狀RNA分子廣泛的翻譯,在circRNAs中發現了一致的m6A motifs,而且單個的m6A位點足以驅動翻譯的起始。而翻譯需要起始因子eIF4G2和m6A reader YTHDF3的參與,甲基轉移酶METTL3/14能夠增強這一過程,去甲基化酶FTO則會抑制翻譯,在熱休克條件下翻譯過程也會增強。進一步通過多聚體分析、計算預測和質譜的方法發現m6A驅動的circRNAs翻譯過程是廣泛存在的,數百種內源的circRNAs都具有翻譯的潛能。這項工作擴展了人類轉錄組編碼的圖譜,并且表明細胞在應對環境壓力的反應中circRNA來源的蛋白具有重要作用。

 

同年哈佛醫學院的科研團隊在Cell Reports上也發文稱circRNAs中存在廣泛的m6A修飾,這種修飾具有細胞特異性,雖然與mRNAs分子共享writing/reading蛋白,但是修飾的位點是與mRNAs明顯不同的。m6A circRNAs多來源于那些產生非甲基化mRNAs的外顯子,而轉錄出甲基化mRNAs的外顯子如果生成m6A circRNAs則會表現出不穩定性,這一過程也會受到YTHDF2的調控。這篇文章豐富了m6A修飾如何調控circRNAs的知識。

 

2019年有4篇相關文章,其中韓國團隊發現了m6A修飾的RNA不穩定性的機制是通過核酸內切酶切割實現的,由YTHDF2-HRSP12-RNase P/MRP信號軸完成,不僅是線性RNA分子受其影響,circular RNA也會被這一信號通路降解(Park et al., 2019, Molecular Cell 74, 1–14)。

 

2019年5月Nature Communications上報道了HPV能夠產生一種環狀RNA分子circE7,在HPV16轉化的細胞中亦能檢測到circE7。進一步發現circE7有多個潛在的m6A修飾位點,受METTL3/14調控,主要富集在細胞質中,與核糖體相關,在熱休克條件下能夠產生E7蛋白。這篇文章很好地證實了病毒來源的蛋白編碼的circRNA具有重要的生物學功能,與一些HPV轉化特性緊密相關(Zhao et al., 2019, Nature Communications 24;10(1):2300)。

 

2019年8月Molecular Cell在免疫方向上發表了m6A的一項重要成果:人內源性的circRNA上如果發生m6A修飾會抑制先天免疫;外源的circRNA能夠在體內作為有效的佐劑誘導抗原特異性T細胞激活、抗體生成及抗腫瘤免疫,而m6A修飾會廢除免疫基因的激活及佐劑活性。m6A reader YTHDF2能夠有效地抑制先天免疫。CircRNA免疫與原核DNA限制修飾系統同樣重要,共同將核酸化學修飾轉化為機體的先天免疫(Chen et al., 2019, Molecular Cell 76, 1–14)。

 

而最近10月份的一篇NC文章更是circRNAm6A修飾和腫瘤發展聯系起來,徹底點燃了circRNA m6A方向研究的熱情,這篇文章也是被多個公眾號解讀。中山大學腫瘤防治中心謝丹、徐瑞華等課題組發現環狀circNSUN2m6A修飾促進其出核轉運,穩定期下游HMGA2從而促進結直腸癌肝轉移

研究人員首先發現circNSUN2在結直腸癌伴有肝轉移患者的腫瘤組織和血清樣本中呈現表達上調,并且預示了較差的預后。In vivo實驗證實了circNSUN2在PDX轉移瘤模型中促進了肝轉移的發生,并且體外實驗也驗證了其促進癌細胞侵襲。更重要的是circNSUN2的m6A修飾促進其出核轉運,通過在細胞質中形成circNSUN2/IGF2BP2/HMGA2這樣一個三元RNA-蛋白復合物,circNSUN2能夠增強HMGA2的穩定性從而促進結直腸癌的轉移進展。臨床上,circNSUN2和HMGA2表達水平的上調在肝轉移組織樣本中比原發的結直腸癌組織更加顯著。這些發現表明circNSUN2可以作為結直腸癌的預后標志物,同時可能成為未來的潛在治療靶點。


 

此外還有兩篇2018年的文章,發現了在C2C12成肌細胞分化中的circRNA表達,并且基于ORFs的數量和m6A motifs預測其編碼潛能(Chen et al., 2018, Cell Cycle);另外一篇其實不涉及到circRNA本身的m6A修飾,circRNA_104075作為一個ceRNA影響了miR-582-3p和YAP mRNA之間的關系,YAP的3’UTR會發生m6A修飾,而這一修飾對于mRNA和miRNA之間的影響是必需的。因此circRNA在這篇文章中充當肝癌診斷marker的作用。

 

 

天昊生物具有多年基因組、轉錄組和表觀組等多組學檢測與分析的經驗,m6A RNA甲基化作為表觀領域的一大熱點,天昊生物可為您提供m6A整體水平定量,結合RNA-seqm6A MeRIP-seq挖掘潛在的受m6A調控酶影響的靶點,同時可對靶點進行MeRIP-qPCR驗證。生信團隊亦可提供個性化的數據庫挖掘與生信分析內容。

歡迎聯系我們!

郵箱:[email protected]

電話:400-065-6886

 

Copyright ? 2012-2020 天昊基因科技(蘇州)有限公司    All Rights Reserved    蘇ICP備17064027號-1
棋牌平台游戏代理 大乐透 日本av女优种子 河南快3 腾讯分分彩 融可赢配资 银行可以给私募基金配资吗 51配资 竞彩篮球大小分 河南快3 为什么nba比分那么高 股票行情软件大全 上证指数由什么决定 山西泳坛夺金 快乐8 快播日本女优伦理电影 股票学习网